A Unifei – Campus de Itabira possui em funcionamento cinco programas de Pós-graduação.
Mestrado
Doutorado
O campus de Itabira passou a integrar o Mestrado Profissional em Recursos Hídricos (ProfÁgua) em 2017, sendo o primeiro programa de pós-graduação gerido e realizado totalmente em Itabira.
Os demais programas possuem origem em Itajubá, contudo, existem professores do Campus de Itabira que fazem parte dos programas como professores permanentes. Isso possibilita que alunos interessados em cursar um dos programas possam desenvolver o curso em Itabira, total ou parcialmente. No caso do Mestrado Profissional em Engenharia de Produção, são abertas turmas exclusivamente para o Campus de Itabira.